PC pro pour calcul intensif et analyse d'images

[Malory Bloody]

Bonjour à tous,

Etant donné qu'il y a quelques personnes travaillant dans l'informatique dans ces murs je me permet de vous solliciter.
J'aurais besoin d'informations concernant les plateformes professionnelle hautes performances.
On m'a demandé des conseils pour ré-équiper un labo de recherche d'un poste d'analyse d'images. Autant pour le grand publique j'ai pas de souci, autant pour ce genre de plate forme je connais beaucoup moins de chose. Mes premières recherche m'ont conduit vers les CPU intel Xeon sur socket 2011.

Le labo en question utilise énormément la microscopie photonique (que ce soit du confocal, FRET, FRAP, Photo-activation, bi-photon et bientôt PALM STORM), avec observation de fluorescence sur plusieurs canaux, Z stack et sur plusieurs heures. Globalement ils font des films qui pèsent entre 30 et 60 GO voir 100GO. Ils disposent de nombreux logiciel comme MATLAB, Imaris, Image J etc...

Ils veulent se ré-équiper d'une machine pour l'avenir sans réel contrainte de prix (entre 10 000 et 12 000 euros). Si parmi vous quelqu'un connait un peu ce genre de produit je serais très content qu'il puisse m'orienter vers quelque chose d’intéressant (que ce soit une technologie, une boite etc). Merci

[Darian eVoke]

[Za Grim]

pas mal

[Karleinzroumenigheu]

Subtil

[Tarh Assiliof]

Ca va être dur de t'aider comme ça rapidement. Leurs besoins ont l'air très spécifiques. Il faut notamment bien étudier la question du stockage, 100Go provenant d'un flux vidéo haute définition, il faut pouvoir l'absorber et le stocker sans lag, sans perte d'image, etc ... et s'ils en sont à 100Go / jour de données, il va falloir un espace de stockage assez dingue, pour qu'ils puissent bosser quelques jours avant de devoir faire de ménage. Il faut regarder du coté des NAS en infinitband ou d'autre truc du genre.

Pour le traitement, ça va aussi dépendre fortement de ce qu'ils font et ont besoin. Ce qui se fait de mieux niveau puissance brute, c'est des clusters de cartes graphiques, notamment les Nvidia quattro, tu en met quelques-une dans un boitier et tu obtiens rapidement une puissance de fou. A condition que les logiciels sachent utiliser les CUBA et que les calculs à effectuer soient massivement parallèles. Avec MatLab, ça pourrait être bon, je sais qu'il peut utiliser les gpu pour certain calculs matriciels. Mais si le logiciel n'est pas prévu pour, tu te retrouve sans rien. Enfin juste le CPU.

Pour les cpu, les xéon, c'est une valeur sur, très fiable, puissant, ... et très cher. Pour un serveur ca se discute pas, mais pour une station de travail qui va juste faire des multiplication à la chaine, avec des bon i7, tu auras bien plus de puissance pour le même prix. Mais si les calculs se font sur les GPU, il n'y a peut-être pas besoin de trop de proc.

Enfin, tout ça demande une sacré analyse des besoins du labo avant de regarder quel modèle de proc ou de carte graphique tu vas prendre. Essaie aussi de contacter des commercial des chez HP, IBM ou de SSII. Ils se feront un plaisir de venir étudier le cas du labo et proposer des solutions adaptés. On en a plusieurs qui sont venu chez nous pour notre nouveau serveur, en comparant les offres, on a pu voir ce qui était le mieux pour nous.

ce qui est bien, c'est la "sans contrainte de prix" tu verras, ça va vite monté à 40'000€

Bon courage.

[Alrik]

Comme le dit Tar, il faudrait une bonne étude en commençant par les logiciels actuels, savoir si ton labo va les garder ou bien prendre des nouveaux logiciels ou une mise jour des actuels.
Une fois que tu sais ça, se renseigner sur les spécificité de ces logiciels, voir le matériel qu'ils sont capable d'exploiter correctement pour demander des offres et pouvoir les comparer.

[Malory Bloody]

Merci pour vos conseils. Je vais commencer à regarder les ressources qu'utilisent les logiciels qu'ils utilisent, au pire ils se démerderont à appeler les commerciaux et tout XD C'est juste pour pas qu'ils se fassent trop avoir. Car en général pour les labos de recherches ils chargent bien la mule niveau coût.

[Zumbala]

Il faut aussi savoir sur quel OS va tourner la bécane, et quel soft va tourner dessus, et quels API peuvent être utilisées: c'est que du calcul CPU brutal, ou y a de l'openCL/CUDA/whatever?
Ca joue énormément sur les perfs: sous Windows sur une appli standard, ça sera peut être un i7, ou un Xeon le meilleur rapport prix perf, sous du Linux, les Opteron valent souvent le cout, même si ils sont largement ignorés: ça bourre quand même, et ça coute pas cher, permettant de très grosses config qui ne rentreraient pas dans ton budget avec du intel.
Sans contrainte de prix, ça passe bien plus loin que 40k€ même, et j'aurais tendance à penser à du power8 sous RedHat